Одной из проблем медленного развития программы "Электронная Москва" всегда было недофинансирование. Первоначально планировалось, что на реализацию данной программы будет израсходовано 60 миллиардов рублей. На сегодняшний же день в "Электронную Москву" было вложено лишь около 3 млрд. руб. из городского бюджета, а также около 2,5 млрд. руб. внебюджетных средств. Это совсем немного, если учесть, если программа, опять же по первоначальным раскладкам, должна быть завершена к 2007 году. Поэтому, в целях ее скорейшего выполнения, столичными властями было решено выделить еще 1,26 млрд. руб, и вместе с тем программу эту значительно упростить, сосредоточившись на реализации ключевых подпрограмм.
Предлагается предусмотреть финансирование работ не только по созданию автоматизированных систем, но и по созданию и поддержанию информационных ресурсов, необходимых для эффективного функционирования этих систем. Определены три тематических уровня Московского городского портала. В верхний тематический уровень войдут: Интернет-сайт Московской городской Думы (duma.mos.ru), Публичный Интернет-портал Правительства Москвы (mos.ru), Интернет-портал Информационного центра Правительства Москвы (mosinform.ru), Общегородской Интернет-портал "Инфоград" (infograd.ru). Средний тематический уровень составят Интернет-ресурсы Московской КСП, прокуратуры, Мосгорсуда, ГУВД Интернет-порталы комплексов Правительства Москвы Интернет-ресурсы не входящих в комплексы ПМ департаментов, комитетов, управлений Интернет-порталы административных округов Москвы. Нижний тематический уровень будет представлен Интернет-ресурсами территориальных органов прокуратуры, МВД, судов г. Москвы Самостоятельные Интернет-ресурсы департаментов, комитетов, управлений в составе комплексов ПМ Интернет-ресурсы ГУП города Москвы Интернет-ресурсы муниципальных образований (районов) г. Москвы.
По словам начальника Управления информатизации города Москвы Алексея Михайлова основные принципы реализации программы "Электронная Москва" - реализация прежде всего важнейших приоритетных проектов, создание инфраструктуры, которая позволит обеспечивать взаимодействие различных городских информационных ресурсов. "Наша задача - выполнить к 2006-2007 гг. ряд приоритетных задач, поднять на более высокий уровень информатизацию территорий, обеспечить условия доступа населения к информационно-коммуникационным услугам правительства Москвы", - резюмировал он. Также он добавил, что "Программа не предполагает расширения сети интернет-кафе или оснащения интернет-линией каждой квартиры. Город не может себе позволить оплатить доступ во "всемирную паутину" всем желающим. Достаточно того, что в перспективе электронные информационные центры будут созданы в каждой префектуре..."